对于一个想要整合部门间的有效资源的机构来说，跨部门合作是必不可少的。而当一个机构足够大的时候，跨部门沟通是很有必要但往往却是很弱的。同样，这里所指的“部门”也可以延伸到相比机构本身的其他行业的其他机构，即人们常说的“第三部门”（Third Sector）这样的概念范畴。
在跨部门合作中，该如何进行跨部门沟通？合作前要注意些什么？
- 理清各部门间的利益，让其明白合作的目标是什么，预期是什么，收益是什么？这些目标、预期、收益还要区分出长期、短期。
- 跨部门间必须有指定的沟通流程。不要像网线一样纷乱，到头来大量的时间都浪费在无效的沟通中。在这里的沟通流程是：专人对接、规定流程。
- 在合作前，找出各方参与的最佳案例，也要找出自身的优点和缺点各是什么。这样做的原因是让各方了解彼此做事情最舒服最有效的姿势、方式是什么。
- 界定职责。要分清楚工作的边界和责任的承担者。
- 建立激励机制，鼓励跨部门、跨平台合作。
- 确立合作计划，并把沟通计划包含进去，要详细到“该如何与利益相关方建立联系”等。同时，也要注意正式和非正式场合的沟通机会的利用等等。